Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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RFXAPO00287 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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RFXAPO00287 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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RFXAPO00287 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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RFXAPO00287 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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RFXAPO00287 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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RFXAPO00287 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RFXAPO00287 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RFXAPO00287 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RFXAPO00287 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RFXAPO00287 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RFXAPO00287 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RFXAPO00287 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RFXAPO00287 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RFXAPO00287 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RFXAPO00287 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RFXAPO00287 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RFXAPO00287 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RFXAPO00287 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
RFXAPO00287 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RFXAPO00287 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
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