Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PHF8Q9UPP1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHF8Q9UPP1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms