Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRPF3Q9ULD4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRPF3Q9ULD4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms