Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DSEQ9UL01 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms