Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPA4Q9UI42 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPA4Q9UI42 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPA4Q9UI42 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPA4Q9UI42 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPA4Q9UI42 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPA4Q9UI42 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPA4Q9UI42 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPA4Q9UI42 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPA4Q9UI42 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPA4Q9UI42 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPA4Q9UI42 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPA4Q9UI42 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CPA4Q9UI42 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPA4Q9UI42 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPA4Q9UI42 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CPA4Q9UI42 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPA4Q9UI42 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPA4Q9UI42 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPA4Q9UI42 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPA4Q9UI42 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPA4Q9UI42 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPA4Q9UI42 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPA4Q9UI42 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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