Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP35Q9P2H5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
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