Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASF1BQ9NVP2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms