Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TULP4Q9NRJ4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms