Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DUOX2Q9NRD8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms