Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CEP44Q9C0F1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CEP44Q9C0F1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms