Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CRNKL1Q9BZJ0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms