Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
FANCD2Q9BXW9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
FANCD2Q9BXW9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
FANCD2Q9BXW9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
FANCD2Q9BXW9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
FANCD2Q9BXW9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
FANCD2Q9BXW9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
FANCD2Q9BXW9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms