Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VN1R3Q9BXE9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms