Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CICQ96RK0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CICQ96RK0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms