Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMG1Q96Q15 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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