Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms