Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM44Q96DX7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms