Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC21AQ8NDW8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC21AQ8NDW8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
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