Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT28Q7Z3Y7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms