Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KNDC1Q76NI1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KNDC1Q76NI1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms