Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SUSD4Q5VX71 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms