Protein–RNA interactions for Protein: Q5K651

SAMD9, Sterile alpha motif domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD9Q5K651 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SAMD9Q5K651 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SAMD9Q5K651 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SAMD9Q5K651 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SAMD9Q5K651 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SAMD9Q5K651 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SAMD9Q5K651 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SAMD9Q5K651 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SAMD9Q5K651 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SAMD9Q5K651 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SAMD9Q5K651 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms