Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00303Q3SY05 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC00303Q3SY05 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms