Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms