Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CUL1Q13616 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
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