Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRF5Q13568 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRF5Q13568 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRF5Q13568 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IRF5Q13568 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IRF5Q13568 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IRF5Q13568 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IRF5Q13568 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IRF5Q13568 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
IRF5Q13568 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
IRF5Q13568 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IRF5Q13568 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IRF5Q13568 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IRF5Q13568 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IRF5Q13568 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF5Q13568 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms