Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCGQ13326 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCGQ13326 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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