Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTGDRQ13258 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGDRQ13258 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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