Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GPS1Q13098 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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