Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
GRIN2AQ12879 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
GRIN2AQ12879 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
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