Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CD164Q04900 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms