Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
IRF8Q02556 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms