Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPAP49450 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPAP49450 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPAP49450 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPAP49450 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPAP49450 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPAP49450 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPAP49450 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPAP49450 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPAP49450 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPAP49450 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPAP49450 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPAP49450 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPAP49450 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPAP49450 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPAP49450 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPAP49450 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPAP49450 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPAP49450 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPAP49450 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPAP49450 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPAP49450 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPAP49450 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPAP49450 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPAP49450 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPAP49450 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPAP49450 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPAP49450 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPAP49450 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPAP49450 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPAP49450 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPAP49450 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPAP49450 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPAP49450 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPAP49450 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPAP49450 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPAP49450 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPAP49450 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPAP49450 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPAP49450 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPAP49450 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPAP49450 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPAP49450 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPAP49450 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPAP49450 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPAP49450 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPAP49450 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPAP49450 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPAP49450 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPAP49450 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPAP49450 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPAP49450 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPAP49450 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPAP49450 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPAP49450 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPAP49450 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPAP49450 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPAP49450 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPAP49450 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPAP49450 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPAP49450 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPAP49450 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPAP49450 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPAP49450 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPAP49450 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPAP49450 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPAP49450 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPAP49450 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPAP49450 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPAP49450 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPAP49450 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPAP49450 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPAP49450 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPAP49450 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPAP49450 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPAP49450 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPAP49450 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPAP49450 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPAP49450 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPAP49450 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPAP49450 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPAP49450 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPAP49450 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPAP49450 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPAP49450 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPAP49450 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPAP49450 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPAP49450 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPAP49450 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPAP49450 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPAP49450 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPAP49450 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPAP49450 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPAP49450 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPAP49450 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPAP49450 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPAP49450 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPAP49450 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPAP49450 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPAP49450 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms