Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP5C1P36542 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP5C1P36542 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms