Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM23P36406 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM23P36406 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms