Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN4AP35499 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCN4AP35499 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCN4AP35499 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCN4AP35499 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCN4AP35499 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCN4AP35499 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCN4AP35499 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SCN4AP35499 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SCN4AP35499 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SCN4AP35499 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCN4AP35499 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCN4AP35499 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCN4AP35499 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCN4AP35499 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCN4AP35499 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN4AP35499 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN4AP35499 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN4AP35499 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN4AP35499 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN4AP35499 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN4AP35499 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN4AP35499 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN4AP35499 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN4AP35499 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN4AP35499 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN4AP35499 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN4AP35499 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN4AP35499 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN4AP35499 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN4AP35499 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN4AP35499 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN4AP35499 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN4AP35499 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN4AP35499 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN4AP35499 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN4AP35499 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN4AP35499 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCN4AP35499 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN4AP35499 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCN4AP35499 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms