Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LMNB1P20700 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMNB1P20700 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms