Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPTA1P02549 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SPTA1P02549 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms