Protein–RNA interactions for Protein: O43822

C21orf2, Protein C21orf2, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C21orf2O43822 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C21orf2O43822 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C21orf2O43822 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C21orf2O43822 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C21orf2O43822 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C21orf2O43822 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C21orf2O43822 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C21orf2O43822 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
C21orf2O43822 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C21orf2O43822 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C21orf2O43822 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
C21orf2O43822 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
C21orf2O43822 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C21orf2O43822 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C21orf2O43822 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
C21orf2O43822 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms