Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HOXA3O43365 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXA3O43365 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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