Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD8O14715 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD8O14715 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD8O14715 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD8O14715 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD8O14715 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD8O14715 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD8O14715 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD8O14715 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD8O14715 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD8O14715 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD8O14715 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD8O14715 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD8O14715 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD8O14715 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD8O14715 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD8O14715 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD8O14715 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD8O14715 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD8O14715 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD8O14715 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD8O14715 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD8O14715 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD8O14715 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD8O14715 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD8O14715 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD8O14715 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD8O14715 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD8O14715 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD8O14715 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD8O14715 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD8O14715 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD8O14715 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD8O14715 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD8O14715 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD8O14715 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD8O14715 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD8O14715 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD8O14715 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD8O14715 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD8O14715 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD8O14715 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD8O14715 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD8O14715 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD8O14715 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD8O14715 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD8O14715 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD8O14715 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms