Protein–RNA interactions for Protein: B4DSR2

cDNA FLJ52234, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DSR2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DSR2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DSR2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DSR2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DSR2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DSR2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DSR2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DSR2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DSR2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DSR2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DSR2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DSR2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DSR2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DSR2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DSR2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DSR2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DSR2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DSR2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DSR2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DSR2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DSR2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DSR2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DSR2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
B4DSR2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DSR2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DSR2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DSR2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DSR2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DSR2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DSR2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DSR2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DSR2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DSR2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DSR2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DSR2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DSR2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DSR2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DSR2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DSR2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DSR2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DSR2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DSR2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DSR2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DSR2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DSR2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DSR2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DSR2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DSR2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DSR2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DSR2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DSR2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DSR2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DSR2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DSR2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DSR2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DSR2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DSR2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DSR2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DSR2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DSR2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DSR2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DSR2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DSR2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DSR2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DSR2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DSR2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
B4DSR2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DSR2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DSR2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DSR2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DSR2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DSR2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DSR2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DSR2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DSR2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DSR2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DSR2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DSR2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DSR2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DSR2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DSR2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DSR2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DSR2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DSR2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DSR2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DSR2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DSR2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DSR2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DSR2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DSR2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DSR2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DSR2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DSR2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DSR2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
B4DSR2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DSR2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DSR2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DSR2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DSR2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
B4DSR2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms