Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
BHMTQ93088 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
BHMTQ93088 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
BHMTQ93088 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
BHMTQ93088 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
BHMTQ93088 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
BHMTQ93088 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
BHMTQ93088 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
BHMTQ93088 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
BHMTQ93088 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
BHMTQ93088 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
BHMTQ93088 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
BHMTQ93088 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
BHMTQ93088 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
BHMTQ93088 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
BHMTQ93088 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
BHMTQ93088 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
BHMTQ93088 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
BHMTQ93088 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
BHMTQ93088 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
BHMTQ93088 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
BHMTQ93088 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
BHMTQ93088 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
BHMTQ93088 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
BHMTQ93088 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
BHMTQ93088 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
BHMTQ93088 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
BHMTQ93088 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
BHMTQ93088 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
BHMTQ93088 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
BHMTQ93088 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
BHMTQ93088 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
BHMTQ93088 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms