Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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GEN1Q17RS7 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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GEN1Q17RS7 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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GEN1Q17RS7 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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GEN1Q17RS7 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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GEN1Q17RS7 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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GEN1Q17RS7 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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GEN1Q17RS7 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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GEN1Q17RS7 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GEN1Q17RS7 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
GEN1Q17RS7 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
GEN1Q17RS7 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
GEN1Q17RS7 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
GEN1Q17RS7 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GEN1Q17RS7 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GEN1Q17RS7 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GEN1Q17RS7 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GEN1Q17RS7 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GEN1Q17RS7 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GEN1Q17RS7 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GEN1Q17RS7 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
GEN1Q17RS7 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GEN1Q17RS7 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GEN1Q17RS7 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GEN1Q17RS7 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
GEN1Q17RS7 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GEN1Q17RS7 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GEN1Q17RS7 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
GEN1Q17RS7 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
GEN1Q17RS7 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GEN1Q17RS7 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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