Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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