Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
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TWIST1Q15672 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TWIST1Q15672 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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