Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL3Q13618 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.21
CUL3Q13618 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CUL3Q13618 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CUL3Q13618 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CUL3Q13618 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CUL3Q13618 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CUL3Q13618 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CUL3Q13618 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CUL3Q13618 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CUL3Q13618 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CUL3Q13618 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CUL3Q13618 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CUL3Q13618 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CUL3Q13618 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CUL3Q13618 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CUL3Q13618 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CUL3Q13618 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CUL3Q13618 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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