Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
TOP3AQ13472 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
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