Protein–RNA interactions for Protein: Q13454

TUSC3, Tumor suppressor candidate 3, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUSC3Q13454 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TUSC3Q13454 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TUSC3Q13454 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TUSC3Q13454 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TUSC3Q13454 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TUSC3Q13454 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TUSC3Q13454 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TUSC3Q13454 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TUSC3Q13454 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TUSC3Q13454 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TUSC3Q13454 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TUSC3Q13454 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TUSC3Q13454 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
TUSC3Q13454 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
TUSC3Q13454 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
TUSC3Q13454 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TUSC3Q13454 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TUSC3Q13454 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TUSC3Q13454 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TUSC3Q13454 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TUSC3Q13454 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TUSC3Q13454 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TUSC3Q13454 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TUSC3Q13454 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
TUSC3Q13454 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TUSC3Q13454 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
TUSC3Q13454 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TUSC3Q13454 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TUSC3Q13454 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TUSC3Q13454 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TUSC3Q13454 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TUSC3Q13454 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TUSC3Q13454 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TUSC3Q13454 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
TUSC3Q13454 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
TUSC3Q13454 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TUSC3Q13454 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TUSC3Q13454 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TUSC3Q13454 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TUSC3Q13454 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TUSC3Q13454 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
TUSC3Q13454 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TUSC3Q13454 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TUSC3Q13454 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TUSC3Q13454 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TUSC3Q13454 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TUSC3Q13454 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TUSC3Q13454 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TUSC3Q13454 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TUSC3Q13454 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TUSC3Q13454 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
TUSC3Q13454 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
TUSC3Q13454 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TUSC3Q13454 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TUSC3Q13454 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TUSC3Q13454 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TUSC3Q13454 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TUSC3Q13454 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TUSC3Q13454 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TUSC3Q13454 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TUSC3Q13454 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TUSC3Q13454 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TUSC3Q13454 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TUSC3Q13454 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TUSC3Q13454 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TUSC3Q13454 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TUSC3Q13454 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TUSC3Q13454 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TUSC3Q13454 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TUSC3Q13454 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TUSC3Q13454 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TUSC3Q13454 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
TUSC3Q13454 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TUSC3Q13454 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TUSC3Q13454 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TUSC3Q13454 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TUSC3Q13454 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TUSC3Q13454 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TUSC3Q13454 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TUSC3Q13454 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TUSC3Q13454 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TUSC3Q13454 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TUSC3Q13454 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TUSC3Q13454 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TUSC3Q13454 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TUSC3Q13454 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
TUSC3Q13454 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TUSC3Q13454 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TUSC3Q13454 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TUSC3Q13454 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TUSC3Q13454 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
TUSC3Q13454 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TUSC3Q13454 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TUSC3Q13454 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
TUSC3Q13454 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TUSC3Q13454 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TUSC3Q13454 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TUSC3Q13454 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TUSC3Q13454 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TUSC3Q13454 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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