Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
MKRN4PQ13434 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
MKRN4PQ13434 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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